Dicom批量转nii(医学影像格式转换,SPM)
实验中需要用spm12进行配准,spm12 配准只能导入nii格式,但影像是dicom格式的,需要先进行格式转换。
spm12有自带的dicom转nii功能,但需要一例一例影像转,费时费力枯燥,好在基于SPM12可以写代码进行批量转换!
1. 在matlab上安装好spm12,安装方法可参考smp12官网
2. 文件组织方式
dicom path:
保存所有dicom的目录,该目录下是一个一个的病例,每个病例的影像分开保存;
每个病例有多个序列的话,每个序列的dicom再分别用文件夹保存。
nii path:
保存格式转化后nii的目录,该目录下是一个一个的病例,每个病例的影像分开保存;
每个病例有多个序列的话,每个序列的nii再分别用文件夹保存。
注:
(一个序列有多个dicom;一个序列可能有多个,SPM12会自动给一个序列的多个nii命不同的名)