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空间转录组基础分析之整合篇

作者,Evil Genius
11月了,又是一年,时间真快
今天这一篇我们来讨论关于空间转录组数据整合的问题,大家在此之前可以先参考一下文章
单细胞基础分析之多样本整合篇
超全总结--单细胞+空间转录组的整合分析方法总结
单细胞多组学整合分析方法讨论
单细胞 & 空间整合去批次方法比较(2)
单细胞 & 空间整合去批次方法比较
关于空间转录组数据的整合问题,一开始认为主要和单细胞数据联合来看细胞的空间位置,现在看来,还是浅,我们来看看空间转录组数据整合分析的内容,这次我们要多参考一篇文章。
2022年8月发表于nature的文章 Spatial multi-omic map of human myocardial infarction对空间组学数据做了整合分析,并且从细胞和分子两个角度进行了整合,这部分整合的内容我详细分享过,文章在时空多样本聚类分析导论,这里就不过多介绍了。

细胞聚类

分子聚类

2022年8月发表于blood的文章Immunothrombosis and vascular heterogeneity in cerebral cavernous malformation仅是看一些关键基因的空间表达,而且大部分文章都是这样。

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