概述
什么是聚类分析
聚类分析是在数据中发现数据对象之间的关系,将数据进行分组,组内的相似性越大,组间的差别越大,则聚类效果越好。
不同的簇类型
聚类旨在发现有用的对象簇,在现实中我们用到很多的簇的类型,使用不同的簇类型划分数据的结果是不同的,如下的几种簇类型。
明显分离的
可以看到(a)中不同组中任意两点之间的距离都大于组内任意两点之间的距离,明显分离的簇不一定是球形的,可以具有任意的形状。
基于原型的
簇是对象的集合,其中每个对象到定义该簇的原型的距离比其他簇的原型距离更近,如(b)所示的原型即为中心点,在一个簇中的数据到其中心点比到另一个簇的中心点更近。这是一种常见的基于中心的簇,最常用的K-Means就是这样的一种簇类型。
这样的簇趋向于球形。
基于密度的
簇是对象的密度区域,(d)所示的是基于密度的簇,当簇不规则或相互盘绕,并且有早上和离群点事,常常使用基于密度的簇定义。
关于更多的簇介绍参考《数据挖掘导论》。
基本的聚类分析算法
1. K均值:
基于原型的、划分的距离技术,它试图发现用户指定个数(K)的簇。
2. 凝聚的层次距离:
思想是开始时,每个点都作为一个单点簇,然后,重复的合并两个最靠近的簇,直到尝试单个、包含所有点的簇。
3. DBSCAN:
一种基于密度的划分距离的算法,簇的个数有算法自动的确定,低密度中的点被视为噪声而忽略,因此其不产生完全聚类。
距离量度
不同的距离量度会对距离的结果产生影响,常见的距离量度如下所示:
K-Means算法
下面介绍K均值算法:
优点:易于实现
缺点:可能收敛于局部最小值,在大规模数据收敛慢
算法思想较为简单如下所示:
选择K个点作为初始质心
repeat
将每个点指派到最近的质心,形成K个簇
重新计算每个簇的质心
until 簇不发生变化或达到最大迭代次数
这里的重新计算每个簇的质心,如何计算的是根据目标函数得来的,因此在开始时我们要考虑距离度量和目标函数。
考虑欧几里得距离的数据,使用误差平方和(Sum of the Squared Error,SSE)作为聚类的目标函数,两次运行K均值产生的两个不同的簇集,我们更喜欢SSE最小的那个。
k表示k个聚类中心,ci表示第几个中心,dist表示的是欧几里得距离。
这里有一个问题就是为什么,我们更新质心是让所有的点的平均值,这里就是SSE所决定的。
下面用Python进行实现
# dataSet样本点,k 簇的个数
# disMeas距离量度,默认为欧几里得距离
# createCent,初始点的选取
def kMeans(dataSet, k, distMeas=distEclud, createCent=randCent):
m = shape(dataSet)[0] #样本数
clusterAssment = mat(zeros((m,2))) #m*2的矩阵
centroids = createCent(dataSet, k) #初始化k个中心
clusterChanged = True
while clusterChanged: #当聚类不再变化
clusterChanged = False
for i in range(m):
minDist = inf; minIndex = -