背景

画图时有的标签是中文的，在RStudio的工作台显示，但是输出为pdf时就是一堆省略号或者小方块。

解决方法

以下是其中一种解决方法，使用Cairo包：

library(Cairo)   ## 主要是加载包
CairoPDF("1-MAD-point.pdf")   ## 这一步很重要
ggplot(df, aes(pos,color=sig)) +
  geom_point(aes(y=diff), shape=16, size=2) +
  xlim(1967516,1967522) + labs(x ="position", y = "diff") +
  labs(y="Methylation difference (早期vs中晚期)", x="position", size=0.1)+
  ggtitle("MAD1L1")
dev.off()  ## 一定要关闭图像窗口

有时候Cairo包也无法让PDF的标签中文显示出来，可以尝试以下命令：

pdf("Name.pdf",family = "GB1")

需要注意的是，在输出pdf文件时RStudio工作台最好不要有打开的图片，不然可能不会输出你想要的结果。