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医学机器学习:数据预处理、超参数调优与模型比较的实用分析

摘要

本文介绍了医学中的机器学习,重点阐述了数据预处理、超参数调优和模型比较的技术。在数据预处理方面,包括数据收集与整理、处理缺失值、特征工程等内容,以确保数据质量和可用性。超参数调优对模型性能至关重要,介绍了多种调优方法及其优缺点和适用场景。模型比较在医学领域具有重要意义,通过比较不同模型可选择最适合特定任务的模型,提高诊断准确性和治疗有效性。最后对医学机器学习的未来发展进行了展望。

关键词

医学机器学习;数据预处理;超参数调优;模型比较

ABSTRACT

This paper introduces machine learning in medicine, focusing on the techniques of data preprocessing, hyperparameter tuning, and model comparison. In terms of data preprocessing, it includes data collection and collation, handling missing values, and feature engineering to ensure data quality and availability. Hyperparameter tuning is crucial for model performance. Various tuning methods, their advantages and disadvantages, and application scenarios are introduced. Model comparison is of great significance in the medical field. By comparing different models, the most suitable model for specific tasks can be selected to improve diagnostic accuracy and treatment effectiveness. Finally, the future development of medical machine learning is prospected.

Keywords

medical machine learning; data preprocessing; hyperparameter tuning; model comparison

一、引言

医学机器学习的重要性与挑战

医学领域中,机器学习的应用价值日益凸显。一方面,机器学习在疾病诊断、医疗影像分析、药物研发等方面发挥着重要作用。例如,在疾病诊断中,机器学习可以通过分析大量的医疗数据,包括患者的症状、病史和实验室检查结果,帮助医生预测患者是否患有某种疾病,还可以进行疾病的风险评估,为医生制定个性化的预防策略提供依据。在医疗影像分析方面,深度学习技术使得计算机能够自动识别和分析医学影像,如 X 光片、CT 扫描和 MRI 图像,帮助医生发现病变、肿瘤和其他异常情况,提高诊断的准确性和效率。在药物研发过程中,机器学习可以用于药物筛选、靶点发现和临床试验设计等环节,通过分析大量的化合物和生物数据,预测哪些化合物可能具有治疗潜力,从而加速药物研发的进程。

然而,医学机器学习也面临着诸多挑战。其中,数据预处理、超参数调优和模型比较是三个关键的挑战。首先,数据预处理是机器学习流程中的重要环节。医疗数据通常来源于电子健康记录、可穿戴设备和基因组学研究等,这些数据往往存在缺失、噪声和格式不一致的情况。例如,属性冗余和数据缺失是数据集普遍存在的问题。为了解决这些问题,需要采用有效的数据清洗和标准化方法。例如,可以通过提高 Relief 算法处理重复属性以及区分低权重属性的能力,实现数据的充分降维;也可以提出一种基于多重置信度的医疗数据缺失值填充方法,提高数据集的填充准确率。其次,超参数调优对于模型性能至关重要。不同的超参数组合可以显著影响模型的性能,因此需要找到一组最佳的超参数组合,使模型在特定任务上表现最佳。例如,可以采用网格搜索、随机搜索、贝叶斯优化等方法进行超参数调优。最后,模型比较也是一个挑战。在医学领域,需要选择最适合特定任务的模型,这就需要对不同的模型进行比较和评估。例如,可以通过准确率、召回率、F1-score 等指标进行模型性能评估,但模型的可解释性问题也不容忽视,复杂模型如深度学习的透明性相对较低,给临床应用带来一定的挑战。

二、医学机器学习中的数据预处理

数据收集与整理

医学数据的收集来源丰富多样,主要包括医院数据库、健康监测设备等。医院数据库涵盖了患者的电子病历、实验室检查结果、影像学报告等大量信息,为医学机器学习提供了基础数据支持。健康监测设备如智能手环、血压计等,可以实时收集患者的生理参数,为疾病的预防和诊断提供动态数据。

在数据整理方面,有多种方法可以采用。首先是去除重复记录,这可以通过对数据集中的关键字段进行比对来实现,确保每一条记录都是唯一的。例如,可以使用数据库管理工具或编程语言中的数据处理库来识别和删除重复的记录。

数据清洗也是重要的一步。在医学数据中,可能存在噪声数据,如异常值或错误的数据。对于异常值,可以通过统计方法进行识别,如判断数据是否超出合理范围。如果某个数据项的取值明显不合理,就需要进行验证和修正。此外,还需要确保数据的准确性和完整性,对缺失值进行处理。对于缺失值,可以采用多种方法进行填充,如均值插补、中位数插补、热卡插补、回归插补等。也可以通过提高 Relief 算法处理重复属性以及区分低权重属性的能力,实现数据的充分降维;还可以提出一种基于多重置信度的医疗数据缺失值填充方法,提高数据集的填充准确率。

数据校对是保证数据逻辑一致性的关键。对数据的逻辑关系进行检查,确保数据的各项值之间逻辑一致。例如,检查患者的年龄、性别、疾病诊断等信息是否符合常理。

在数据整理过程中,可以利用 Excel 和 Epidata 等工具。Excel 在数据录入方面有许多技巧,如记住常见快捷键、拒绝合并单元格、调整行列宽度、拒绝录入重复值等,这些技巧可以提高数据整理的效率。Epidata 作为一款免费的数据录入工具,因其软件小巧、界面友好、数据导出格式多样以及可进行数据核查等优点,深受研究者喜爱。

对于医学影像数据的收集与整理,首先需要从不同的来源获取这些图像,并确保每张图片都有相应的标签(如“正常”或“肺炎”)。数据预处理包括检查图像质量、去除重复项、确保所有标签都是准确的,以及调整图像大小以保持一致性、将图像转换为灰度图或标准化颜色空间、应用增强技术,如旋转、翻转等。将数据集划分为训练集、验证集和测试集时,可以按照一定比例进行划分,例如 70%(训练)、15%(验证)和 15%(测试)。

对于临床数据的收集,可以采用电子病历系统、临床数据仓库、移动应用与可穿戴设备、患者自我报告、跨学科合作等方法。电子病历系统可以方便快捷地获取患者的基本信息、病史、诊断、治疗等数据;临床数据仓库是一个集中存储和管理临床数据的系统,可以从中提取各种类型的数据;移动应用和可穿戴设备可以实时监测患者的健康状况,并收集相关数据;患者自我报告是一种简单而直接的数据收集方式,让患者直接描述自己的症状、治疗体验等;跨学科合作可以与其他学科的研究者进行合作,共享数据和资源。

总之,医学机器学习中的数据预处理是一个复杂而关键的环节,需要采用多种方法和工具,确保数据的质量和可用性,为后续的机器学习模型训练提供可靠的基础。

处理缺失值

在医学数据中,缺失值是一个常见的问题。常见的处理方式主要有填充和删除两种。

一、填充缺失值

  1. 均值插补:用该指标的平均值填补缺失值。优点是操作简单,能够在一定程度上保持数据的完整性。但缺点也较为明显,可能会掩盖数据的真实分布情况,尤其是当数据存在异常值时,均值可能会被拉高或拉低。
  2. 中位数插补:用该指标的中位数填补缺失值。相比均值插补,中位数对异常值不敏感,更能反映数据的中心位置。然而,它也可能无法准确反映数据的全貌,尤其是在数据分布较为分散的情况下。
  3. 热卡插补:用与该样本相似的样本的平均值填补缺失值。这种方法考虑了样本之间的相似性,可能会比单纯的均值或中位数插补更准确。但是,确定相似样本的标准可能比较主观,而且计算量也相对较大。
  4. 回归插补:根据其他指标建立回归模型,预测缺失值。这种方法利用了数据之间的相关性,可以得到较为准确的缺失值估计。但是,回归模型的建立需要一定的专业知识和计算资源,而且如果回归模型不准确,可能会引入更多的误差。

二、删除缺失值

直接删除包含缺失值的样本或指标是处理缺失值最简单的方法。优点是不会引入额外的误差,而且操作简单。但是,这种方法可能会导致数据量减少,降低分析的准确性。尤其是当缺失值较多时,删除可能会使样本量大大减少,影响后续的分析结果。

不同的处理方法各有优缺点,在实际应用中,需要根据具体情况选择合适的方法。例如,对于关键指标中的缺失值,建议直接删除,以保证关键数据的可靠性;对于非关键指标,如果缺失值的数量较多或分布不均匀,则也可以考虑删除。对于缺失值较少的指标,可以进行插补。在进行插补之前,可以进行预分析,将所有缺失值删除和进行插补后分别观察分析结果是否发生明显变化,找出对分析结果影响较大的关键指标。同时,也可以结合多种插补方法,以提高缺失值处理的准确性。

特征工程

在医学数据中,特征工程起着至关重要的作用。它主要包括将分类变量转换为数值、构建新特征等操作,能够极大地提升机器学习模型在医学领域的性能。

一、将分类变量转换为数值

在医学数据中,常常会遇到分类变量,如性别、疾病类型等。为了让机器学习模型能够处理这些变量,需要将其转换为数值形式。常见的方法有以下几种:

  1. 独热编码(One-Hot Encoding:对于具有多个离散值的分类变量,可以使用独热编码。例如,对于性别变量{‘男’,‘女’},可以设置为{‘男’:[0,1],‘女’:[1,0]}。这样可以避免模型对不同类别之间的大小关系产生错误的理解。
  2. 数值映射:对于具有明确顺序关系的分类变量,可以进行数值映射。例如,对于疾病的严重程度变量{‘轻度’,‘中度’,‘重度’},可以设置为{‘轻度’:1,‘中度’:2,‘重度’:3}。但需要注意的是,这种方法可能会引入一些不合理的假设,因此需要谨慎使用。

二、构建新特征

除了将分类变量转换为数值,还可以通过构建新特征来提高模型的性能。构建新特征的方法主要有以下几种:

  1. 特征组合:基于对医学问题的专业知识理解,对现有几个特征进行组合生成新的特征。例如,可以将年龄和血压两个特征组合成一个新的特征,如年龄与血压的乘积。这样可以捕捉到两个特征之间的交互作用,提高模型的表现力。
  2. 数据变换:利用数据变换技术,如多项式特征、函数变换等,创造出新的特征。例如,使用 sklearn 库中的 PolynomialFeatures 可以生成多项式特征,从而增加特征的维度和复杂性。但需要注意的是,过高的特征维度可能会导致过拟合问题,因此需要进行适当的特征选择和降维。

总之,特征工程在医学数据中的作用不可忽视。通过合理地进行特征工程操作,可以提高机器学习模型的性能,为医学诊断、治疗和研究提供更准确、可靠的支持。

超参数调优的重要性

超参数在机器学习模型中起着至关重要的作用,它们对模型性能有着显著的影响,因此超参数调优是医学机器学习中不可或缺的环节。不同的超参数组合可以极大地改变模型的性能表现,所以找到一组最佳的超参数组合,能使模型在特定的医学任务上发挥出最优性能。

例如,在贝叶斯优化中,这种调优方法通过构建概率模型来指导搜索过程,平衡探索和利用,避免陷入局部最优解,大概率找到全局最优解。它利用历史信息指导搜索,在搜索过程中会充分利用之前的评估结果来更新后验概率模型,从而更智能地选择下一组候选参数。同时,贝叶斯优化通常需要更少的迭代次数就能够找到满意的解,对于计算资源有限的医学场景尤其重要,大大节省了资源和时间成本。而且,贝叶斯优化不仅适用于参数较少的情境,同样也能够有效处理高维参数空间的问题,其智能搜索策略使得即使在高维空间中,也能够有效地导向性能较好的区域。贝叶斯优化已被广泛应用于各种机器学习任务中,包括医学领域的深度学习模型超参数调整、强化学习算法的策略优化、特征工程中的参数选择以及自动机器学习中的算法选择和超参数优化等。

除了贝叶斯优化,还有遗传算法、基于梯度的优化、网格搜索、Keras Tuner、基于种群的优化、ParamILS、随机搜索等超参数调优方法。遗传算法通过根据特定规则修改一组候选解决方案来工作,在超参数调整问题中已被证明比基于精度/速度的网格搜索技术表现更好。基于梯度的优化基于机器学习模型选择标准相对于超参数的梯度计算,在满足一定条件时可以应用。网格搜索是超参数调优的基本方法,对用户指定的超参数集执行详尽的搜索,但搜索空间有限。Keras Tuner是一个库,允许用户为机器学习或深度学习模型找到最佳超参数。基于种群的优化结合了并行搜索和顺序优化,其中DeepMind提出的基于种群的训练(PBT)较为独特,允许在训练期间使用自适应超参数。ParamILS是一种用于自动算法配置的通用随机局部搜索方法。随机搜索是对网格搜索的基本改进,已证明比后者创建更好的结果,但仍然是一种计算密集型方法。

总之,超参数调优对于医学机器学习模型性能至关重要,通过选择合适的调优方法,可以找到最佳的超参数组合,提高模型在医学任务中的准确性、可靠性和泛化能力。

常见超参数调优方法

  1. 网格搜索方法原理与流程优缺点分析
    1. 原理与流程:网格搜索是超参数调优的基本方法。它对用户指定的超参数集执行详尽的搜索。具体来说,通过定义一个超参数的搜索空间,然后对这个空间中的每一种可能的参数组合进行尝试,在给定的数据集上训练模型并评估性能,最终选择表现最佳的参数组合。
    2. 优缺点分析
      1. 优点
        1. 直接:是一种最直接的调优方法,能够确保遍历所有可能的参数组合,从而找到最准确的预测结果。
        2. 简单易懂:对于初学者来说,网格搜索的概念和操作相对容易理解,不需要复杂的算法知识。
      2. 缺点
        1. 搜索空间有限:当超参数数量较多或者取值范围较大时,网格搜索的计算成本会急剧增加,可能无法在合理的时间内完成搜索。
        2. 计算资源消耗大:由于需要对每一个参数组合进行训练和评估,对于大规模的数据集或复杂的模型,网格搜索可能需要大量的计算资源。
  2. 随机搜索与网格搜索的区别优势与局限性
    1. 与网格搜索的区别:随机搜索不像网格搜索那样尝试所有可能的组合,而是在参数空间中随机选取参数组合。
    2. 优势
      1. 高效:在大参数空间中比网格搜索更加高效,不需要测试所有可能的参数组合。随机搜索可以在较短的时间内找到一个不错的解,尤其是当参数空间非常大时,随机搜索的优势更加明显。
      2. 探索性更强:由于是随机选取参数组合,因此有机会探索到一些不太常见的参数组合,可能会发现一些意外的好结果。
    3. 局限性
      1. 无保证:由于其随机性,不能保证找到全局最优解,特别是在迭代次数有限的情况下。
      2. 结果的随机性:同样的参数和设置可能导致不同的搜索结果,这使得随机搜索的结果不太稳定。
  3. 贝叶斯优化基于贝叶斯统计理论的调优方式实现复杂程度与适用场景
    1. 基于贝叶斯统计理论的调优方式:贝叶斯优化通过构建概率模型来指导搜索过程,它不仅侧重于探索模型性能表现好的区域,同时考虑到了探索未知区域的重要性。这种平衡探索和利用的能力,使它在全局搜索中表现出色,大概率避免陷入局部最优解,而寻找到全局最优解。在搜索过程中会充分利用之前的评估结果来更新后验概率模型,从而更智能地选择下一组候选参数。
    2. 实现复杂程度:相对于网格搜索和随机搜索,贝叶斯优化算法的实现和调试更为复杂。每一步都需要更新代理模型,可能需要高昂的计算成本,尤其是在参数维度非常高的情况下。
    3. 适用场景
      1. 复杂模型:适用于深度神经网络等复杂模型,能够在较少的函数评估次数内找到最优解,特别适用于评估代价高的情况。
      2. 非凸优化问题:可以很好地处理非凸的优化问题,在各种机器学习任务中都有广泛的应用,包括深度学习模型的超参数调整、强化学习算法的策略优化、特征工程中的参数选择以及自动机器学习中的算法选择和超参数优化等。
  4. 遗传算法优化算法的工作原理在超参数调优中的表现
    1. 优化算法的工作原理:遗传算法是一种优化算法,它通过根据称为算子的某些规则修改一组候选解决方案(种群)来工作。在超参数调优中,种群中的每个个体代表一组超参数组合,通过模拟生物进化过程中的“选择、变异、交叉”等操作来不断优化超参数组合。
    2. 在超参数调优中的表现:在超参数调整问题中,遗传算法已被证明比基于精度/速度的网格搜索技术表现更好。它能够在较大的参数空间中进行搜索,并且具有较强的鲁棒性,能够避免陷入局部最优解。然而,遗传算法的计算成本也相对较高,需要进行多次迭代才能找到较好的解。
  5. 基于梯度的优化适用条件与计算方法对超参数调整的作用
    1. 适用条件与计算方法:基于梯度的优化是一种优化多个超参数的方法,基于机器学习模型选择标准相对于超参数的梯度计算。当满足训练标准的一些可微性和连续性条件时,可以应用这种超参数调整方法。具体来说,通过计算模型性能关于超参数的梯度,然后根据梯度的方向来更新超参数,以提高模型性能。
    2. 对超参数调整的作用:基于梯度的优化可以在一定程度上加快超参数调整的速度,特别是对于连续的超参数。它能够利用梯度信息来指导超参数的更新方向,使得超参数调整更加高效。然而,这种方法也有一定的局限性,对于不可微的超参数或者不满足连续性条件的模型,基于梯度的优化方法可能无法应用。
    3. Keras Tuner用于深度学习模型的超参数调优查找最佳参数的优势
      1. 用于深度学习模型的超参数调优Keras Tuner是一个库,允许用户为机器学习或深度学习模型找到最佳超参数。它可以用于调整内核大小、优化学习率和不同的超参数。
      2. 查找最佳参数的优势
        1. 灵活性:与 Keras 工作流程紧密结合,但不仅限于此,它也可以用于调优 scikit-learn 模型或其他任何需要调优的模型。
        2. 多种调优策略:提供了 RandomSearch、Hyperband 和 BayesianOptimization 等多种调优策略,用户可以根据自己的需求选择合适的策略。
        3. 可视化:可以使用 TensorBoard 的交互式图表来可视化超参数值和相应的评估结果,帮助用户直观地理解超参数对模型性能的影响。
  6. 基于种群的优化类似遗传算法的随机搜索方法独特之处与应用场景
    1. 类似遗传算法的随机搜索方法:基于种群的方法本质上是一系列基于随机搜索(如遗传算法)的方法。最广泛使用的基于种群的方法之一是 DeepMind 提出的基于种群的训练(PBT)。
    2. 独特之处
      1. 允许在训练期间使用自适应超参数,能够根据模型的训练情况动态调整超参数,提高模型的性能。
      2. 结合了并行搜索和顺序优化,能够在较短的时间内找到较好的超参数组合。
    3. 应用场景:适用于大规模的深度学习模型训练,特别是在计算资源充足的情况下,可以充分发挥其并行搜索和自适应超参数调整的优势。
  7. ParamILS自动算法配置方法的介绍在超参数调优中的应用
    1. 自动算法配置方法的介绍:ParamILS(参数配置空间中的迭代局部搜索)是一种用于自动算法配置的通用随机局部搜索方法。它使用默认和随机设置进行初始化,并采用迭代第一改进作为辅助本地搜索过程。
    2. 在超参数调优中的应用:ParamILS 有助于开发高性能算法及其应用程序。它使用固定数量的随机移动来进行扰动,并且总是接受更好或同样好的参数配置,但会随机重新初始化搜索。在超参数调优中,ParamILS 可以在一定程度上提高超参数调整的效率,特别是对于复杂的模型和大规模的数据集。

模型比较的意义

在医学领域中,比较不同机器学习模型具有至关重要的意义。首先,医学数据的复杂性和多样性决定了单一的机器学习模型往往难以满足各种临床需求。不同的模型在处理不同类型的数据和解决不同的医学问题时表现各异。例如,在脑出血患者的诊断和治疗中,不同的机器学习模型可能会对患者的院前指标和院中指标有不同的分析和预测能力。通过对多种模型进行比较,可以选择最适合特定任务的模型,提高诊断的准确性和治疗的有效性。

其次,模型比较有助于评估模型的性能和可靠性。医学决策关系到患者的生命健康,因此需要选择性能稳定、可靠的模型。通过比较不同模型在准确率、召回率、F1-score等指标上的表现,可以评估模型的准确性和全面性。同时,还可以考虑模型的可解释性,尤其是在临床应用中,医生需要了解模型的决策依据,以便更好地为患者提供治疗建议。例如,在比专家更“专业”的机器学习模型准确预测患者术后风险的研究中,机器学习模型在灵敏度、特异性方面优于人类专家和现行通用的风险预测计算器,AUC 值最高达 0.924。这表明通过模型比较,可以选择出性能更优的模型,为临床决策提供更准确的支持。

此外,模型比较还可以促进机器学习在医学领域的发展。通过对不同模型的比较和分析,可以发现模型的优势和不足,为进一步改进和优化模型提供方向。例如,在对脑出血患者进行系统性院前急救护理与多学科协作式院内急救护理的效果研究中,不同的急救护理方法对患者的急救时间、抢救成功率和并发症发生率等指标有不同的影响。通过比较这些方法,可以找到更有效的急救护理模式,提高患者的生存率和生活质量。同时,模型比较也可以促进不同研究团队之间的交流和合作,共同推动机器学习在医学领域的应用和发展。

不同模型在医学中的应用案例

  1. 逻辑回归二分类模型在医学诊断中的应用评估指标与性能分析
    1. 逻辑回归是一种常用的二分类模型,适用于预测患者是否患有某种疾病。例使用逻辑回归对患者的电子健康记录进行分析,通过选择特征和标签,划分训练集和测试集,训练逻辑回归模型并进行预测,最后使用准确率和ROC AUC等指标评估模型性能。
    2. 在二分类任务中,可以使用一种简单且可解释的性能指标,如正确分类的概率(PCC)。PCC考虑了真正率(TPR)和真负率(TNR),即PCC = (TPR + TNR)/2。TPR = TP /(条件正例)= TP /(TP + FN),TNR = TN /(条件负例)= TN /(TN + FP)。PCC告诉我们分类器在检测任何一个分类中有多好,它是一个概率值[0,1]。
    3. 此外,还可以使用mlr3实现二分类资料多个模型评价和比较。用mlr3包对二分类数据进行模型评价和比较,包括逻辑回归模型。通过建立任务、数据预处理、选择多个模型、建立benchmark_grid、开始计算、查看模型表现结果可视化和选择最好的模型等步骤,对逻辑回归等模型进行评估。
  2. 随机森林集成学习方法的优势在医学数据中的准确性与稳定性
    1. 随机森林是一种集成学习方法,通过构建多个决策树来提高模型的准确性和稳定性。使用随机森林对患者的电子健康记录进行分析,通过训练随机森林模型并进行预测,最后使用准确率和ROC AUC等指标评估模型性能。
    2. 随机森林模型进行二分类资料的模型评价和比较。通过建立任务、数据预处理、选择多个模型、建立benchmark_grid、开始计算、查看模型表现结果可视化和选择最好的模型等步骤,对随机森林等模型进行评估。
    3. 随机森林在处理医学数据时具有以下优势:首先,它能够处理高维度的数据,并且对噪声和异常值具有较好的鲁棒性。其次,随机森林可以通过特征重要性评估来确定哪些特征对预测结果贡献最大,有助于医生理解模型的决策依据。此外,随机森林的集成性质使其在准确性和稳定性方面表现出色,适用于各种医学任务,如疾病诊断、治疗方案推荐等。
  3. 深度学习处理复杂医学数据的能力不同深度学习模型的特点与应用
    1. 深度学习模型在处理复杂医学数据方面具有强大的能力。深度学习在医学图像处理中的应用。深度学习迅速成为医学图像处理的主流研究热点,能够提高医疗效率和诊断准确率。
    2. 深度学习模型对患者的电子健康记录进行分析,通过构建深度学习模型、编译模型、训练模型和评估模型等步骤,展示了深度学习在医疗诊断中的应用。
    3. 不同的深度学习模型具有不同的特点和应用。例如卷积神经网络(CNN)在处理图像数据方面表现出色,循环神经网络(RNN)在处理时间序列数据方面具有优势。在医学领域,CNN可以用于医学影像分析,如X光片、CT扫描和MRI图像的病变检测和诊断;RNN可以用于分析患者的生理信号数据,如心电图、脑电图等,以预测疾病的发生和发展。此外,深度学习还可以与其他机器学习方法结合使用,如集成学习,以进一步提高模型的性能和稳定性。

基于脑出血患者院前指标的模型比较

以脑出血患者为例,阐述多种机器学习模型在预测神经功能预后中的性能比较。

脑出血是一种严重的神经系统疾病,具有高致残率和高死亡率。及时准确地预测患者的神经功能预后对于制定个性化的治疗方案和提高患者的生活质量至关重要。在这个过程中,机器学习模型发挥着重要作用。

一、模型构建与求解

本文首先使用 Logistic 回归模型、Lasso 回归模型,对院前指标进行筛选,证明了院前指标相较于以往认为占据主导因素的院中指标,同样对 ICH 患者神经功能预后有重要影响。后以 ICH 患者院前指标为自变量,神经功能预后情况为结局变量,训练支持向量机、BP 神经网络、决策树及随机森林等五个机器学习方法,以比较研究各类模型在基于院前指标预测 ICH 患者神经功能预后的性能。

二、模型性能比较

  1. Logistic 回归模型:Logistic 回归是处理二分类资料的标准方法,在医学领域多用于临床医学的鉴别诊断、评价治疗策略、分析疾病预后因素等。对于脑出血患者的神经功能预后预测,Logistic 回归模型可以通过分析院前指标,如吸烟、喝酒、既往卒中史等既往病史资料以及入院体征检查如 NIHSS、GCS 等量表评分,来判断患者的神经功能预后情况。然而,Logistic 回归模型属于概率型非线性回归,其性能可能受到数据分布的影响,在处理复杂数据时可能表现不佳。
  2. Lasso 回归模型:Lasso 回归模型可以通过对系数进行压缩,实现变量选择和降维的目的。在脑出血患者的院前指标筛选中,Lasso 回归模型可以帮助我们确定哪些院前指标对神经功能预后有重要影响,从而减少模型的复杂度,提高模型的预测性能。但是,Lasso 回归模型的性能也受到超参数的影响,需要进行适当的调优。
  3. 支持向量机模型:支持向量机是一种基于结构风险最小化原则的机器学习方法,在处理小样本、非线性和高维数据时表现出色。对于脑出血患者的神经功能预后预测,支持向量机模型可以通过寻找一个最优的超平面,将患者分为不同的预后类别。然而,支持向量机模型的计算复杂度较高,需要大量的计算资源和时间。
  4. BP 神经网络模型:BP 神经网络是一种前馈神经网络,通过反向传播算法进行训练。在脑出血患者的神经功能预后预测中,BP 神经网络模型可以自动学习院前指标与神经功能预后之间的复杂关系,具有很强的非线性拟合能力。但是,BP 神经网络模型容易陷入局部最优解,需要进行适当的初始化和调优。
  5. 随机森林模型:随机森林是一种集成学习方法,通过构建多个决策树来提高模型的准确性和稳定性。在脑出血患者的神经功能预后预测中,随机森林模型可以通过对多个决策树的预测结果进行集成,减少模型的方差,提高模型的泛化能力。此外,随机森林模型还可以通过特征重要性评估来确定哪些院前指标对神经功能预后贡献最大,有助于医生理解模型的决策依据。

三、模型应用案例

在实际应用中,不同的机器学习模型在脑出血患者的神经功能预后预测中都有一定的应用价值。例如,在对脑出血患者进行系统性院前急救护理与多学科协作式院内急救护理的效果研究中,通过比较不同的急救护理方法对患者的急救时间、抢救成功率和并发症发生率等指标的影响,可以为选择最适合的急救护理模式提供依据。在高血压性脑出血患者院前急诊治疗方案及疗效评估中,通过比较接受院前急诊治疗和未接受院前急诊治疗的患者的死亡率、致残率与抢救成功率等指标,可以证明院前急诊治疗对于提高患者的生存质量具有重要意义。

综上所述,不同的机器学习模型在脑出血患者的神经功能预后预测中具有不同的性能特点和应用场景。在实际应用中,需要根据具体情况选择合适的模型,以提高预测的准确性和可靠性。同时,还需要不断探索新的机器学习方法和技术,为脑出血患者的神经功能预后预测提供更好的支持。

五、结论

医学机器学习中的数据预处理、超参数调优和模型比较是确保机器学习模型在医学领域有效应用的关键环节。

在数据预处理方面,通过多种方法收集医学数据,包括医院数据库、健康监测设备等。对数据进行整理,去除重复记录、清洗噪声数据、处理缺失值、校对数据逻辑一致性,并利用工具如 Excel 和 Epidata 提高整理效率。在处理缺失值时,有填充和删除两种方式,包括均值插补、中位数插补、热卡插补、回归插补等填充方法,以及根据情况直接删除包含缺失值的样本或指标。特征工程包括将分类变量转换为数值和构建新特征,提升机器学习模型在医学领域的性能。

超参数调优对模型性能至关重要。不同的超参数组合会极大影响模型性能,因此需要找到最佳组合。常见的超参数调优方法有网格搜索、随机搜索、贝叶斯优化、遗传算法、基于梯度的优化、Keras Tuner、基于种群的优化、ParamILS、Hyperband 等。这些方法各有优缺点,适用于不同的场景。

模型比较在医学领域具有重要意义。由于医学数据的复杂性和多样性,单一模型难以满足各种临床需求。通过比较不同模型,可以选择最适合特定任务的模型,提高诊断准确性和治疗有效性。同时,模型比较有助于评估模型性能和可靠性,考虑准确率、召回率、F1-score 等指标以及模型的可解释性。此外,模型比较还能促进机器学习在医学领域的发展,为改进和优化模型提供方向。

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